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这些基因相关的科研套路你不得不知

2017-08-02 14:02:10弗雷赛斯

本次讲的是常用的几个知识点,技术方法的套路都差不多,依葫芦画瓢就是。


 

甲基化相关

甲基化不少方法其实都淘汰了,建议亲们做甲基化之前还是先咨询一下,只有方法确定好了,后续做起来才能得心应手。特别是msp,简单省钱,但不能定量的,杂志社退稿就不好了,这种情况不时发生。


 


SNP检测相关

snp检测的方法是多种多样,方法其实基本都可靠的,已经很成熟,主要是两点,一点是实验目的,二是样品与位点个数,根据这两点,来确定方法,不要一上来就说我要这个方法,这个方法靠谱,那你要是不考虑经费,土豪直接用焦磷酸测序的方法(这个仪器也用于甲基化测序)吧,还能分辨杂合突变的比例,岂不是更靠谱?
 


 

RNA相关

主要是mRNA、lncRNA、micRNA、circRNA,其他偏门的也不好做

以上均可测序,其中circRNA不建议芯片,测序结果不咋地(主要是数据组装分析问题),但普遍反应比芯片要好。其他三种,测序与芯片各有千秋,根据各自的需要选择。

 


 


物种鉴定

2个专利号,物种鉴定的万能钥匙)

        利用基因组测序技术提供动植物、细菌、真菌等各类物种的鉴定服务,其中真核生物鉴定利用的是相关DNA条形码数据库,包括COI、ITS、rpcl等barcode基因;原核生物利用的是genebank基因组数据库及“金标准”isDDH/ANI技术。基因组学技术适用于各种复杂样本的物种成分鉴定,有效补充的PCR+sanger测序技术的不足之处。


STR鉴定
 

你买的是人来源的细胞吗,是否污染?万一买回来的不是需要的,那后面的都完了。几百块钱还是不要省。


 

暑假到了,抓紧时间做实验,做完实验就可以回家休息了,因为暑假期间,农活早就做完了(学医的别走,你老板喊你暑假值夜班)~~
 

 


 

作者琳琳猫----


 一个会烹饪会写古文的耿直女子,浙江大学食品工程学硕士,曾就职于华大基因7年。有丰富的snp,甲基化,rna检测等方法学研究经验。

试剂测评专栏

一定是进口试剂好么?国内同类产品哪个好?哪个性价比好?在这个鱼龙混杂的行业,一不留神就被坑。我们是科学严谨的,光靠公司吹嘘我不干,之后在这个栏目,我们要拿实验数据来说话,猫姐在这个行业13年,乐于分享,勇于承担,Freescience将和猫姐一起,做一些事情,倒逼这个行业的质量能够越来越好。