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基因测序解开罕见病谜题?

2017-08-23 20:15:09中国罕见病

UCLA是首批使用外显子组测序的医学中心之一


在经历一系列检查未果后,Calvin Lapidus在UCLA接受了外显子组测序,使得医生能够识别出他所患的罕见病,即皮特-霍普金斯综合征。

当10个月大的儿子Calvin没有达到翻身或爬行这样的正常里程碑时,Audrey Lapidus知道有些不对劲儿。

“他和我们的第一个孩子确实不同,”来自洛杉矶的Lapidus说,“他有许多肠胃问题,我们多次带他去看医生。”

4位专家看了Calvin,一系列检查的结果没有得出结论。但Lapidus依然坚持认为Calvin身体是有问题的。

“我要求进行更多的检查,然后我们加州大学洛杉矶分校(UCLA)的遗传学家说,‘如果你能再等一个月,我们将推出一种被称为外显子组测序的全新测试’”她说,“我们很幸运能在合适的时间合适的地点,获得了我们想要的信息。”

2012年,CalvinLapidus成为首位在UCLA接受外显子组测序的患者。他随后被诊断出患有一种被称为皮特-霍普金斯综合征(Pitt-Hopkins syndrome)的罕见遗传病,该病最常见的特征是发育迟缓、可能的呼吸问题、癫痫发作和肠胃问题。

虽然皮特-霍普金斯综合征目前无法治愈,但最终获得诊断允许Calvin开始接受治疗。“这一诊断让我们有了向前的起点,而不是停留在一无所知的可怕无人之地,”Lapidus说道。

“不幸的是,有很多人生活在那个无人之地上,渴望着他们医学疾病的任何答案,”UCLA大卫格芬医学院人类遗传学和病理学和实验室医学教授Stanley Nelson博士说,“许多家庭多年来一直在遭受折磨,却不知道折磨他们的疾病的名字。”

外显子组测序允许医生通过简单的血液测试,一次分析超过20000个基因。

过去,基因检测一次测试一个基因,既耗时又昂贵。

“与一个个测试序列基因不同的是,外显子组测序可以节省时间、金钱和精力,”UCLA雷斯尼克神经精神医院儿科医生和研究员Julian Martinez-Agosto博士说道。

外显子组由所有基因组的“外显子”构成,外显子是基因的编码部分。临床外显子组测序是一种测试,用于识别1%编码蛋白质的基因组中、外显子中或编码区域两侧中的致病性DNA变异。

到目前为止,基因的蛋白质编码部分中的突变约占所有已知致病基因突变的85%,因此考察这部分基因组是一种高效而强大的诊断工具。外显子组测序能够帮助检测脊髓小脑性共济失调(该病会进行性削弱个人运动能力)这样的罕见疾病,并提示更常见疾病的可能性,比如自闭症谱系障碍和癫痫。

自2012年以来,超过4000名成人和儿童在UCLA接受了外显子组测试。在难以解决的病例中,超过30%通过该过程得到解决,比之前技术进步很多。因此,Nelson和他的团队支持更广泛地使用基因组测序技术和更好的保险覆盖,这将进一步造福患者并在患者更年轻的时候解决难以诊断的病例。

自从儿子获得诊断,Lapidus帮助创立了皮特-霍普金斯综合征研究基金会。“Calvin获得的诊断给了我们从哪里开始、到哪里去的路标,为我们指明了疗法和治疗的现实,”她说,“如果没有这个测试,这些都是不可能的。”

接下来,UCLA的专家们将测试更广泛全基因组测序的相对优势,以分析构成个人基因组的全部60亿个碱基。该团队正在探索将这种DNA测序与最先进的RNA或基因表达分析进行整合,以提高诊断率。

1990年,整个人类基因组首次被测序,耗资27亿。今天,医生们可以用该费用的一小部分进行同样的测试,并且相信,个人的全基因组测序可以极大地改善疾病诊断和医疗护理。

原文链接:

http://newsroom.ucla.edu/stories/ucla-genetic-sequencing-unravels-rare-disease-mysteries

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原文翻译/曹文东

校审/夏蓓

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