基因测序+液体活检滴血查癌登堂入室

2017-08-25 11:01:06健点子ihealth

肿瘤发生早期，影像学检测难发现？

肿瘤发现后，组织活检取样太痛苦？

肿瘤术后复发难察觉？

基于下一代测序（NGS）的液体活检技术正在解决这些问题！

液体活检（liquid biopsy）是体外诊断的一个分支，通过血液或尿液对癌症等疾病做出分析诊断。

提到液体活检技术，就不得不提“无创产检（NIPT）之父”卢煜明教授。卢教授在收治一名孕妇时得到启发，把胎儿疾病筛查和癌症检测进行嫁接。

一名孕妇想通过NIPT技术检测自己的胎儿是否健康。在检测这名女性的血液后，发现有很多不正常的染色体，而这些染色体不是源于胎儿，而是淋巴细胞。进一步检查后发现这名准妈妈不幸患有淋巴瘤。

在与产前筛查（NIPT）技术相同的理论支持下，卢煜明教授决定同时研究癌症的检测。这一技术，我们现在称为“癌症的液体活检”。

传统的癌症检测主要依赖于影像学检查和组织活检，其灵敏度低且易造成创伤。

传统的组织活检技术有其无法克服的局限性，主要包括：肿瘤的异质性；某些患者自身情况不适合做组织活检；手术有加速肿瘤转移的风险；肿瘤监测的滞后性。

液体活检相比于组织活检的优势在于：

1）无创；

2）能够检测传统手段无法检测到的肿瘤组织情况；

3）能够反映肿瘤实时信息，实现动态监测，达到指导用药、耐药监测等目的；4）克服了肿瘤异质性，获得更全面的肿瘤信息。

目前，癌症的液体活检主要是利用血液中的循环肿瘤细胞（CTCs）、循环肿瘤DNA（ctDNA）、外泌体。

液体活检在国内蓬勃兴起。

开展液体活检二代测序产品的公司主要有：

准确性如何？

本月发表在《癌细胞》（Cancer Cell）上的一篇文章首次利用肿瘤化的血小板RNA（TEPs）。运用ThromboSeq测序技术检测了来自超过700名患者血液样本中的5000个RNA分子，对早期和晚期的非小细胞肺癌（NSCLC）的检出率分别为81%和88%。

这篇文章的两位作者获得了测序产品生产商Illumina公司的资助，而且作者自己是Grail公司的股东。

Grail公司的发言人表示，公司不会进一步发展这项技术。而Illumina公司对此未做出回应。

同样在本月，发表在《科学转化医学》（Science Translational Medicine）上的一文中，约翰霍普金斯大学的维克多·维库克斯库（Victor Velculescu）领导的团队对ctDNA进行大规模平行测序。

他们分析58个癌症基因，以检测早期癌症。这项被称为靶向误差校正测序（TEC-Seq）的技术，对I期或II期结直肠癌、乳腺癌、肺癌和卵巢癌的体细胞突变检出率分别为71％、59％、59％和68％。

个人基因组诊断（Personal Genome Diagnostics）公司拥有TEC-Seq的知识产权，并且正在将该技术运用于产品开发。但是，奇怪的是，该公司也表示，目前不打算商业化任何用于癌症早期检测的产品。

相比之下，国内的企业对滴血查癌很是看好。

深圳的华大集团和其旗下的完整基因组学公司（Complete Genomics Inc.，2013年被BGI收购）在一位雌激素受体阳性/ HER2阴性转移性乳腺癌患者身上确定了驱动突变和起源组织。公司计划在不久的将来将更加先进、便宜的版本商业化。

开展液体活检二代测序产品的公司主要有：

公司	产品	用途
思路迪	康路明-肺腺癌（32个基因）、优路明-肺癌（63个基因）	肺癌检测
诺禾致源	肿瘤用药基因和遗传易感检测	肺癌、结直肠癌、乳腺癌等多种实体瘤，提供检测服务包括肿瘤防治全过程
鼎晶生物	Onco drug seq 肺癌18基因、Onco drug seq 通用21基因	肺癌检测、全癌检测
泛生子	泛明安无创基因检测	用药指导、耐药监测，覆盖癌症全周期诊疗各个环节
元码基因	10K液体活检	肺癌、乳腺癌、结直肠癌、胰腺癌、甲状腺癌、黑色素瘤、胃肠道间质瘤检测
海普洛斯	无创基因检测	个性化治疗
贝瑞和康	昂科益无创基因检测	靶向用药、动态疗效监测
赛默飞	Oncomine cfDNA Assay	用药、复发监测
安诺优达	ctDNA无创个体化诊疗基因检测	指导用药
燃石	朗克-血液版、朗清、普清	为临床中一线无法取得足够组织样本的非小细胞肺癌患者治疗方案提供参考信息；朗清针对非小细胞肺癌；普清针对全癌种
吉因加	Gene+OncoD	肺癌、乳腺癌、消化道肿瘤、全癌种检测
优讯	优旭循环肿瘤DNA（ctDNA）检测	癌症检测
华大基因	Oseq Drug、Oseq ctDNA	检测、用药指导

靶向测序

除了大规模非靶向测序，靶向测序也可以常规地从大量患者中确认潜在癌症突变。

发表在《癌症研究》（Cancer Research）上的文章，由Guardant健康公司和加州大学圣地亚哥分校（UCSD）的研究表明，对患有包括胃肠、脑和肺的各种癌症的670名患者的血液样本进行液体活检的第二代测序，检测多达70个基因小组。63％的患者中至少有一个突变。该文作者Guardant使用目前市场化的Guardant360非侵入性泛癌血液检测进行了数字测序。

在另外一篇《癌症研究》文章中，UCSD和Guardant团队使用液体活检的第二代测序，在442例未知原发癌患者的液体活检中评估多达70个基因。作者发现除了其中一例具有潜在危险突变外，80％的患者有ctDNA突变，其中一例具有“潜在的可靶向改变”。

从这些近期发表的液体活检的文章中我们可以看出，测序技术的发展和引入，可以提高液体活组织检查的敏感性，并降低其错误阴性率。同时靶向测序技术缓解了人们对第二代测序大量反馈数据但方向不明确的信息的担忧。

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参考文章：

https://www.biocentury.com/bc-extra/preclinical-news/2017-08-18/papers-describe-liquid-biopsy-next-generation-sequencing
http://www.cell.com/cancer-cell/abstract/S1535-6108(17)30296-9
http://stm.sciencemag.org/content/9/403/eaan2415
http://med.sina.com/article_detail_103_2_26058.html