如何方便获取基因&药物对应证据?
编者按
在临床选择用药方案时,我们需要很多基因与药物的证据进行支撑,同时还需要在上下游信号通路中找寻关联基因的研究结果,最终形成对于该基因用药方案的整体认识。PharmGKB数据库就可以方便地解决这一问题。
如何使用PharmGKB平台,获取基因&药物对应证据?
步骤一:
打开PharmGKB网站,输入想研究的基因名,进行查找;
步骤二:
比如GSTP1基因,从搜索结果中,有批准的药(Drug Labels)以及临床的相关证据(Clinical Annotation);
步骤三:
——①搜索GSTP1
点击show lower-evidence Clinical Annotation
在每一个文献下会有证据级别、相对应的RS、肿瘤相关类型、以及研究的人种;
在下方会有与该基因每个RS相对应的药物及证据证据
步骤三:
——②搜索EGFR
如果我们搜索EGFR,则可以找到19种药物,以及18个临床证据;
步骤四:查看注释
在搜索结果页面下方,会有针对该证据的相关药物,通过注释内容,有助于更好的了解;
步骤五:信号通路图
在搜索结果页面下方,还有针对该基因的信号通路图,可以点击查看该通路的大图,并且有相应的文献进行说明。