『鱼话基因』第贰辑
低血糖+黄疸+贫血
好的工具，让复杂遗传病易于被诊断
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导语
以HPO表型工具为纽带，连接海量基因数据与纷繁临床症状。
用真实临床案例为例证，聚合NGS检测应用与临床诊断实践。
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临床信息
刘某某，性别女，1月7天
主要临床症状：皮肤黄染44天，退而复现，贫血，低血糖，有输过红细胞；姐姐一个月时因多脏器功能衰竭去世，有一个叔叔1岁时不明原因夭折；血尿质谱检测阴性
初步诊断：1胆汁淤积？2遗传代谢疾病？3染色体异常？
HP:0001943,Hypoglycemia;
PCK2 DOLK PCK1 LRPPRC GHR MPC1 PCCB PCCA NDUFB3 MEN1 AKT2 AGL FBP1 UQCRB LHX4 NDUFB9 BCS1L CPT2 FAH NDUFA11 NNT PYGL PRKAG2 H19-ICR HMGCL MC2R ETFDH SLC25A20 SETD2 GK MLYCD DBH GH1 PTEN CDON PNPO HSD3B2 SERAC1 UQCRC2 DBT UQCC3 NR3C1 HSD17B10 HESX1 HRAS KCNQ1OT1 ABCC8 NUBPL TANGO2 ATP7A ACADM CYP11A1 PPM1B OTX2 PC GPR161 GCK IGF2 H19 IGF1 DLD MPV17 MRAP PHKA2 GYS2 KCNQ1 MCCC2 MCCC1 GJA1 PREPL ACAD9 SLC3A1 HNF4A MPI SLC22A5 SUCLG1 NSD1 RNF125 FGF20 ACADVL ITGA8 TMEM126B RET CTDP1 NDUFAF5 NDUFAF4 NDUFAF1 NDUFAF3 NDUFAF2 HADH SLC52A1 NDUFV2 NDUFV1 CDKN1C KDM6A MTO1 TBX19 NFKB2 ETFA HMGCS2 ETFB NDUFA1 AUH ACADSB POMC GHSR CAMKMT EIF2AK3 GLUD1 PPP1R15B DGUOK GALT G6PC CA5A INSR SOX3 GCDH SLC37A4 HADHB HADHA GLI2 FOXRED1 HNF1A PROP1 NDUFS4 CPT1A KCNJ11 CYP21A2 PCSK1 PPP2R5D GPC3 GPC4 APC2 UCP2 ALDOB POU1F1 SLC16A1 OTC NOTCH3 POGZ NDUFS1 NDUFS2 NDUFS3 BCKDHB NDUFS6 BCKDHA
HP:0001943,Hypoglycemia;
HP:0000952,Jaundice;
LHX4 ETFDH HESX1 ATP7A MPV17 HNF4A TBX19 ETFA ETFB EIF2AK3 DGUOK GALT PROP1 ALDOB POU1F1
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案例分析
SierraVast遗传类疾病标准分析流程
Bp Score 排名第一名？
HPO表型集：低血糖、高氯性代谢性酸中毒、半乳糖尿症、高半乳糖血症、肝硬化、肝功能下降、黄疸、呕吐、腹泻、肝脏肿大、婴儿期喂养困难、慢性肝功能衰竭、骨密度降低、生育能力下降、促性腺激素分泌亢进、氨基酸尿、卵巢早衰、脓毒症、智力残疾、震颤、神经语言障碍、不协调、认知障碍、未能茁壮成长、体重减轻、声音异常、溶血性贫血、白内障、常染色体隐性遗传、意识和困惑丧失。
多表型，临床符合，致病分数高，基因致病可能性大。家系验证结果突变来自父母双方。
临床表型
半乳糖血症
案例延伸的个人观点
1、HPO表型标准录入、表型基因筛选工具+智能化基因致病性算法，解读基因数据的利器。
2、儿童，尤其是小儿ICU，很多症状表型奇怪患儿，在排除常见遗传代谢病（血尿），应该考虑基因筛查。
3、系统化数据工具和多指征临床分析工具，可以有助于大大提高基因解读人员对临床信息的理解能力。
